辦公室（保密辦公室）負責行政工作的管理、檢查、督辦，協(xié)調(diào)日常運轉；承擔公文流轉、安全保密、密碼管理、新聞宣傳、辦公信息化、信訪、保衛(wèi)、機要、檔案管理和綜合統(tǒng)計等工作，承擔內(nèi)部審計工作。

 

黨委辦公室（簡稱“黨辦”）負責黨委的日常運轉工作，負責思想政治建設、基層黨組織建設、精神文明建設等工作，協(xié)助黨委領導工青婦等群眾工作和統(tǒng)戰(zhàn)工作。

 

紀委辦公室（簡稱“紀辦”）負責紀委的日常運轉工作，承擔監(jiān)督執(zhí)紀問責等相關工作。

 

人事處（離退休干部處）負責干部選拔、干部監(jiān)督、人才隊伍建設、教育培訓、勞動工資、研究生培養(yǎng)、博士后工作站、干部人事檔案管理、離退休人員管理等工作。

 

財務資產(chǎn)處（簡稱“財務處”）是中心財務、國有資產(chǎn)和政府采購的歸口管理部門。主要職能是，負責建立健全中心內(nèi)部的財務管理制度、編制中心的部門預算和財務決算；負責各類資金的統(tǒng)一集中管理；指導和監(jiān)督中心資產(chǎn)和政府采購管理的執(zhí)行情況。

 

業(yè)務發(fā)展與國際合作處（簡稱“業(yè)務處”）負責業(yè)務和科技發(fā)展規(guī)劃，管理業(yè)務科研項目、科技創(chuàng)新平臺和重大專項，管理成果轉化項目，組織成果轉化推廣，組織國際合作、學術交流及學會協(xié)會等工作。

 

項目管理處（簡稱“項目處”）負責海洋環(huán)境保障工作的歸口管理。

 

質(zhì)量管理處（總工程師辦公室）（簡稱“質(zhì)管處”）負責質(zhì)量管理體系有效運行管理、標準化管理、業(yè)務科研項目技術管理、認證認可管理等工作。